目前的流域水环境管理呈现“垂直分级负责，横向多头管理”的局面，直接导致“责权利”的不统一，争权不断，推责有余。流域上下游水污染防治补偿机制也没有建立，上游地区不仅缺乏治污积极性，甚至通过流域的过度开发带动经济的增长。在不断积累的环境问题面前，传统的治理方式已显得“力不从心”。

    因此，环保总局呼吁必须建立跨部门跨流域的统一综合治理机制，根据流域整体性组织环保、水利、城建、林业、农业等部门开展联合监测和执法。

    有专家表示，水污染治理是对政府行政、宏观调控能力的严峻考验，不仅仅是环保部门“一家之事”；而“统一”、“综合”并不等于“多头并管”，前两者有利于形成监管合力，实现治理的有效性，而后者则容易产生推诿和扯皮。

    北京市环境保护科学研究院水污染控制研究所的宋英豪表示，统一综合的治理机制是环保部门一直在讨论的一个问题。是将水污染控制提高到一个流域的概念上，而并不仅仅是省市行政部门的一个调控问题；统一起来有利于政策的执行。

    除了治理机制上的统一之外，建立全新的环境经济政策体系也显得必要和必需。全新的环境经济政策体系意味着结合行政与市场的力量来遏制污染恶化趋势。据悉，环保总局将联合银监会在近期出台绿色信贷政策，未执行环评审批和验收的项目，未按环保审批要求落实环保措施而被环保部门查处的企业将不能得到各金融机构的信贷支持。以此为开端，环保总局将联合更多部门在近年内研究出台绿色保险、绿色证券、绿色财税等一系列新政策。

    同时，在当下我国工业化与城市化飞速发展的关键时刻，单纯用行政手段来解决环境污染问题已行不通；而综合运用经济的、行政的、法律的、甚至社会的手段才能更有效。